Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRKQ15262 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
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PTPRKQ15262 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
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