Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ODF1Q14990 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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