Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB39AQ14964 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms