Protein–RNA interactions for Protein: Q14739

LBR, Lamin-B receptor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBRQ14739 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LBRQ14739 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LBRQ14739 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LBRQ14739 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LBRQ14739 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms