Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SMC1AQ14683 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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