Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SQLEQ14534 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms