Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms