Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOFQ13790 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOFQ13790 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOFQ13790 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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