Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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