Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRQ13535 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRQ13535 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRQ13535 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRQ13535 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRQ13535 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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