Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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