Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RIGQ13278 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RIGQ13278 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RIGQ13278 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RIGQ13278 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RIGQ13278 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RIGQ13278 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RIGQ13278 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RIGQ13278 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RIGQ13278 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RIGQ13278 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RIGQ13278 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RIGQ13278 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RIGQ13278 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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