Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms