Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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