Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms