Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC173Q0VFZ6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms