Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBRQ0VD83 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms