Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMOD3Q0VAK6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms