Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4CQ08493 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms