Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms