Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms