Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCNT1Q02742 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms