Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms