Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms