Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms