Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms