Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms