Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP3K9P80192 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms