Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL8P80075 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL8P80075 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL8P80075 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms