Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS3AP61247 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms