Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms