Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BACE1P56817 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BACE1P56817 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms