Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP12AP54707 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms