Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB3P54284 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms