Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms