Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MRE11P49959 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRE11P49959 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRE11P49959 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRE11P49959 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRE11P49959 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRE11P49959 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRE11P49959 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRE11P49959 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRE11P49959 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRE11P49959 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRE11P49959 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRE11P49959 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms