Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ETFBP38117 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ETFBP38117 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ETFBP38117 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ETFBP38117 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ETFBP38117 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ETFBP38117 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ETFBP38117 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ETFBP38117 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms