Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms