Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4AP27815 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4AP27815 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4AP27815 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4AP27815 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4AP27815 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4AP27815 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4AP27815 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms