Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms