Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms