Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HRCP23327 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HRCP23327 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HRCP23327 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HRCP23327 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HRCP23327 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HRCP23327 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HRCP23327 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HRCP23327 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HRCP23327 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms