Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSR1P21757 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSR1P21757 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSR1P21757 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSR1P21757 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSR1P21757 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSR1P21757 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSR1P21757 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSR1P21757 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSR1P21757 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSR1P21757 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MSR1P21757 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MSR1P21757 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MSR1P21757 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MSR1P21757 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MSR1P21757 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MSR1P21757 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSR1P21757 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSR1P21757 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSR1P21757 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSR1P21757 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSR1P21757 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSR1P21757 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSR1P21757 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSR1P21757 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSR1P21757 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MSR1P21757 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms