Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASTP20810 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CASTP20810 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CASTP20810 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASTP20810 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASTP20810 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASTP20810 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASTP20810 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASTP20810 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASTP20810 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASTP20810 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASTP20810 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASTP20810 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASTP20810 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASTP20810 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASTP20810 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASTP20810 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASTP20810 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASTP20810 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASTP20810 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASTP20810 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms