Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A1P19634 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms