Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF1P18846 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATF1P18846 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATF1P18846 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms