Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCC1P18754 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCC1P18754 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCC1P18754 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCC1P18754 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCC1P18754 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms