Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB9P17482 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB9P17482 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms