Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRF1P14222 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRF1P14222 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms