Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL2P13500 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCL2P13500 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL2P13500 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms